柚苷酶的核心作用是特异性降解柑橘类原料中的苦味物质柚苷，因此其应用主要集中在以柚子、葡萄柚、橙子、柠檬等为原料的食品加工中，通过改善产品苦味问题，提升感官品质，同时简化生产工艺（减少传统脱苦方法的能耗和污染），在天然、健康食品趋势下应用日益广泛。

1. 柑橘果汁加工

• 橙汁、柠檬汁等澄清果汁：柑橘果实（如柚子、葡萄柚、橙子）中含有大量柚苷，导致果汁带有明显苦味。柚苷酶可将柚苷的糖苷键水解为无苦味的柚配基和鼠李糖，有效去除苦味，提升果汁的适口性。同时，酶解过程不会破坏果汁中的维生素、风味物质等营养成分，保持产品天然特性。
• 浓缩果汁生产：在果汁浓缩前使用柚苷酶处理，可避免浓缩过程中苦味物质的富集，确保浓缩果汁稀释后仍具有良好口感。

2. 柑橘类饮料加工

• 调配型柑橘饮料：如含柚子、柠檬成分的碳酸饮料、果蔬复合饮料等，添加柚苷酶可降解原料带来的苦味，平衡饮料的酸甜度，扩大产品受众（尤其适合对苦味敏感的消费者）。
• 发酵型柑橘饮料：在柑橘果酒、发酵乳饮料等生产中，柚苷酶预处理可降低原料苦味，减少苦味对发酵菌种的潜在抑制，同时提升发酵产品的风味协调性。

3. 柑橘果酱与蜜饯加工

• 果酱制作：柚子、橙子等柑橘果酱在加工中，果肉和果皮中的柚苷会释放到果酱中，导致苦味过重。柚苷酶处理可分解苦味物质，使果酱口感更柔和，同时不影响果酱的稠度和色泽。
• 蜜饯加工：在柚子皮、橙皮蜜饯生产中，柚苷是主要苦味来源。通过柚苷酶浸泡或喷淋处理，可高效去除果皮中的柚苷，减少传统工艺中反复漂洗带来的营养流失和废水排放，同时缩短加工周期。

4. 柑橘风味食品加工

• 糕点、糖果等烘焙 / 休闲食品：当添加柑橘汁、果皮粉作为风味原料时，柚苷酶可预先处理原料，去除苦味，使柑橘风味更纯正。例如，柚子味蛋糕、柑橘味硬糖等，通过酶解处理可避免苦味对产品风味的干扰。
• 果冻与布丁：在柑橘风味果冻生产中，柚苷酶可降低果汁原料的苦味，确保产品酸甜适中，提升口感细腻度
  除食品加工外，柚苷酶还可用于医药领域（如制备柚配基等活性成分，研究其抗氧化、抗炎作用）和农业领域（如改良柑橘品种的苦味特性）。